Ну вы бы описали полностью алгоритм действий, которые вы совершаете, и уточнили условия.
А вообще идеально было бы загрузиться в Linux, посмотреть gdisk / fdisk все разделы, примонтировать их ручками и искать свои файлы - если они есть, они есть. Если их нет - значит их нет. Всё остальное - козни ОС, имхо.