У материнской платы потребление тока ничтожное, в ней будет работать любая исправная батарейка (достаточно проверить вольтметром, что у нее на выходе около 3 вольт).
Разница между батарейками 2032 проявляется только в устройствах, потребляющих значительный ток - пульты, автомобильные ключи, фонарики...