К сожалению, ни разу не встречал такого, насколько я знаю, задание фиксированной структуры - ограничение нейронной сети. И это в общем-то понятно, если в случае уменьшения входов ещё понятно что делать - выключать forward propagation на лишних нейронах (что, в общем-то можно сделать просто заполняя недостающую информацию нулями), то в случае увеличения не очень понятно, откуда брать веса связей с нейронами следующих уровней.
Поэтому классически эту проблему решают предобработкой данных к одному размеру. Например, ресайз картинок к одному размеру, даже в случае потери качества. В сложном случае можно сделать несколько кропов фиксированного размера и устроить голосование по результатам на выходе.