А зачем вручную запускать копирование?
1. Копируем ключ любого пользователя входящего в группу disk(по-крайней мере у меня на gentoo так), ну или root'а, на инстанс для backup'ов.
Пример.
2. Добавляем в загрузку скриптик непосредственно осуществляющий копирование. Ябы на вашем месте прислушался к
colonel и использовал rsync. В конце скрипта поместил бы команду poweroff. Всё, скрипт отработал, инстанс выключился.