Изначально проблема заключалась в том я папку Downloads перенёс в папку Desktop. Спустя пару часов ковыряния в интернете у меня получилось нормализировать всё, что я там натворил (а натворил я больше чем я здесь написал) и в итоге у меня всё абсолютно нормально было не считая того, что папка с моим пользователем является папкой с типом Загрузки. Из-за этого она отображается слева в проводнике и я когда открываю вижу все свои файлы пользователя. Всё же, внутри у меня осталась настоящая папка Загрузки в которую скачиваются файлы и т. д.
Короче говоря, если поменять тип папки с юзером на нормальную папку, слева будет отображаться настоящая папка Загрузки и всё (в теории) должно стать на свои места, но я в душе не чаю как это сделать.
Надо просто поменять тип одной системной папки на другой тип.
Мало что понял, но немного прокомментирую.
У папок нет типа. Это просто каталоги в файловой системе, обычные каталоги.
Иконка, псевдоним и т.п., что может отображаться в проводнике вместо имени каталога задаются в файле desktop.ini, который лежит в этом же каталоге. Это скрытый файл, поэтому по умолчанию он в проводнике не виден. Чтоб его увидеть надо включить отображение скрытых файлов. Этот файл можно удалить, тогда все настройки, которые есть в нем для папки не будут применяться в проводнике.
В общем, я думаю, вам надо удалить (или переименовать, чтоб была возможность вернуть обратно) файл desktop.ini из каталога с профилем пользователя и посмотреть что получится.