Роман

1. Пишете нужный класс с нужными данными: Как правильно описать класс для библиотеки Newtonsoft.Json C#?
   
2. Открываете ман Newtonsoft.json в разделе конвертеров: https://www.newtonsoft.com/json/help/html/CustomJs... и далее в гугле.
   
3. Пишете свой конвертер
   
4. Радуетесь результату
   

Данные погут меняться только от действий пользователя. Так что включите режим read only пока идет сохранение и никто ничего поменять не сможет

Перегрузка индексатора

public class Foo : Dictionary<string, int>
{
    public new int this[string key]
    {
        get => this.GetValueOrDefault(key);
        set => base[key] = value;
    }
}

Foo f = [];
string k = "key";
Console.WriteLine($"Value not set: {f[k]}");
f[k]++;
Console.WriteLine($"Value ++: {f[k]}");
f[k]++;
Console.WriteLine($"Value ++: {f[k]}");
f[k]--;
Console.WriteLine($"Value --: {f[k]}");

Value not set: 0
Value ++: 1
Value ++: 2
Value --: 1

int a { get; }
Свойство только для чтения: можно записать только в конструкторе или инициализаторе, а в методах класса и других способах нельзя изменить.

int a { get; private set; }
Свойство только для чтения снаружи класса: можно записать только внутри класса - в конструкторе, методе и в остальных способах.

Ну сборка - это то что в dll-файле, да.

Где ты прочитал о статических и динамических я не знаю, по тому загуглил сам.

Статическая сборка - это такая, сборка, которая сохранена как dll-файл.
Динамическая - которая создана при помощи System.Reflection.Emit и существует только в рантайме.

Условие цикла for написано не верно:

// for(int i = 0; i >= _inventory.Length; i++)
for(int i = 0; i < _inventory.Length; i++)

// Или если _inventory изначально может быть пуст, а значит и перебирать там нечего.
for(int i = 0; i <= _inventory.Length; i++)

Ты можешь создать сборку (грубо говоря, проект/.csproj), которая называется Service.Domain, но все классы там будут в неймспейсе (пр-ве имен) Another.Namespace
Т.е. название проекта не накладывает ограничений на названия пр-в имен, которые в нем хранятся.

смотрите в будущее:
- просто десктопная утилита? реализуйте по пути наименьшего сопротивления
- есть задумки на дальнейший рост? тогда изучайте паттерны. приложение под большую нагрузку, все больше становится похожим на веб-приложение

Использовать стандартные паттерны типа MVC и MVVM. Для большинства приложений этого достаточно. Если приложение более сложное, то оно делится на компоненты в виде, опять же, стандартных библиотек и приложения/приложений.

Можно. Разрешаю

В данном случае проще всего будет просто связать оба инстанса друг с другом и использовать второй инстас как резервный. Например через банальную проверку друг друга по сети запросом каким-нибудь. Один инстанс работает, а другой проверяет, что первый инстанс работает верно. Если первый инстанс не отвечает, висит, сломался и т.п. - в работу включается второй и где-нибудь ставит флаг/файл/что угодно и как, что теперь он основной, а первый - резервный будет, когда заработает и отправляет сообщение ответственному.

Чуть более сложный вариант: использовать, например, редис для хранения состояния процесса работы и через него синхронизировать инстансы. Например: первый сервис определил для себя задачу и сообщает об этом второму, что он взял такую-то задачу или такие-то файлы. Соответственно второй сервис эти файлы не трогает. Или, оба инстанса смотрят в каталог, как только что-то обнаруживают - помещают в очередь задач. А при появлении задачи в очереди - оба сервер генерируют случайно число и так выбирают кто из них возьмет следующую задачу из очереди. Т.о. можно, этих инстансов наплодить сколько угодно.

Более правильный вариант: разделить функционально вашу задачу на несколько более простых. А именно: вместо проверки каталога, запустить на том сервере, где находится данный каталог с файлами сервис наблюдения ФС, который использует системные уведомления об изменениях файловой системы. И при наступлении нужных событий - отправляет запрос в очередь на обработку, например в тот же редис, а оттуда запрос забирает один из инстансов и обрабатывает его.

Почему C# не кроссплатформенный?

На этот вопрос нельзя ответить сразу по двум причинам:
1. C# - это язык, а язык не может быть кросс-платформенным, так как платформы в разрезе языка и нет.
2. .NET уже много лет как кросс-платформенный.
Начиная с уже мейнстримного .NET 8, заканчивая mono и всякой экзотикой типа nano framework

но при этом, это не так

Ничто нельзя запустить на "чём угодно"

но в неё вопрос кроссплатформенности решена абсолютно полностью

Если вопрос "абсолютно полностью" решён, то почему я не могу запускать программы, написанные на Java, на любом железе?

Это называется Top Level Main - https://metanit.com/sharp/tutorial/1.4.php (начиная с C# 9)
Кратко - нет смысла переделывать.
Функциональность та же самая, разница только в том, что Main() генерируется компилятором, но преимущество - можно не заморачиваться над сигнатурой (например, можно влепить async/await и не менять void на async Task)

Но это не верно с точки зрения логики,

Почему не верно? Конкретный тип всегда можно привести к базовому.
Джон не человек? Кошка не животное?
Вот наоборот уже нельзя: например нельзя People ob = new object(); - будет ошибка, тк object - слишком абстрактный тип.

PS: чтобы не мучать отвечающего - лучше делай нормальные отступы в коде.

Это вообще правильно?

Да, это правильно и это по сути единственный адекватный способ отмены долгоиграющих операций.
Когда-то давно у потоков был метод Abort, но его удалили, тк его использование очень часто приводило к неприятным багам.
Ну и пихать проверку cancellation token повсюду не обязательно.

Поток вызывает 1 функцию библиотечную неуправляемого кода, как ее прервать?

Безопасно - никак, если эта неуправляемая функция не предоставляет интерфейс для отмены.
Даже если бы и был способ (тот же Abort), то прерывание неуправляемого кода очень вероятно приведёт к утечке ресурсов (в лучшем случае не будет освобождена динамическая память)

NPOI и OpenXML Sdk