Влияет очень сильно.
Советую хорошо выучить анимацию на CSS3:
здесь - отличный "быстрый" учебник.
Я бы сказал, что нужно делать так:
1. Установка параметров и события, отличающиеся от тех, что есть в CSS - используем JS
2. Прокрутка готового ролика для объекта - CSS
Т.е., весь по-кадровый просчёт - оставлять на CSS.