1. Больше влезет обычных php-mod
2. Некомпетенция ( прийдется допиливать убогие админки для работы с этим модом)
3. пхп флаги не работают в FastCGI из .htaccess а следвательно нужно еще допиливать разрешения на кастомизацию php.ini, опять же кривые руки и всем нехочется, или ставить патч.
4. Дорогой хостинг может предоставить любые представления php из разумных разумеется. Все зависит от админа и не более.
5. Некоторые кренделябры всеже на FastCGI чуть чуть работают по другому а служба тех поддержки не особо горит желанием что то делать в направление увеличения звонков с вопросами.