Вы не указали ОС. В мире unix для этих дел есть procmail. Postfix может с хидерами работать. В любом случае это должен быть свой мейлер с которым Вы можете пробовать разные правила
Предлагаю генту. Незабываемый конструктор. Полная кастомизация как ядра, так и прикладного ПО. Работа в только консоли (можно и гуи, но гента не для этого)
