res2001

Установите VS2005 и запускайте сборку из консоли студии, а не из обычного cmd: ссылка на консоль должна быть в меню Пуск в папке со студией.

В предположении, что все папки находятся в одном корневом каталоге (в примере c:\tmp), то примерно так будет:

@echo off
set "source_dir=c:\tmp"
for /f "tokens=* delims=" %%a in ('dir /s/b "%source_dir%\*" ') do (
  rar a "%%~dpna" "%%~fa"
  del /f/q "%%~fa"
)

Если папки разбросаны по разным местам, то нужно вносить изменения, например хранить список папок в текстовом файле или в переменной, затем в цикле перебирать каждую папку и упаковывать. Схема будет похожа на вышеприведенный скрипт, немного изменится цикл. Более предпочтительным видится вариант хранения списка папок в отдельном текстовом файле

В вопросе ничего не сказано куда записывать архивы. Если их записывать туда же, где были исходные файлы, то при повторном вызове скрипта будет конфликт. Нужно предусмотреть пропуск архивных файлов.

1.На сколько я знаю в прошлых версиях винды скрытие разделов происходило просто указанием их в таблице разделов не на первом месте, т.е. с флэшки отображался только первый раздел (о чем по ссылке Ezhyg то же пишут).
В ВИн10 после какого-то большого обновления это убрали и теперь на флэшке видны все разделы.
2.В логических разделах нет смысла, когда на диске до 4 разделов.
3.Загрузка UEFI и Legacy BIOS осуществляется с помощью разных механизмов.
3.1.UEFI для загрузки использует EFI раздел на диске и размещенные в этом разделе загрузочные *.efi файлы.
EFI раздел - это раздел с файловой системой FAT16 или FAT32. Загрузочные efi файлы должны лежать в строго определенном месте в файловой системе, где их ищет UEFI.
3.2.Legacy boot - использует старый механизм MBR (master boot record). MBR - это нулевой сектор на диске. Для того что бы это работало нужно какой-то из разделов сделать активным, этот раздел не может быть логическим, только основным. Именно с активного раздела происходит дальнейшая загрузка ОС. Кроме этого на диск нужно записать MBR - некий код, который осуществляет дальнейшую загрузку. MBR записывается в 0 сектор диска, он не является частью файловой системы (т.е. его нельзя записать скопировав куда-нибудь файл), для его записи необходим спец. софт. У груба есть свой MBR, у винды - свой, и т.д.
4.Загрузку с флэшки и в UEFI и в legacy режиме успешно решают многие. Например есть диагностическая сборка WinPE, где это решено. Для разбиения диска, записи MBR и т.п. действий там используется утилита bootice. Можете скачать архив с adminpe, там есть инструкция как сделать загрузочную флэшку с несколькими разделами и там по моему то же используется grub.
Кстати, в bootice было удобно скрывать разделы - там это реализовано одной кнопкой - она просто переписывавет таблицу разделов, где разделы указаны в нужном порядке. Правда сейчас это уже не актуально.

Для shadow не нужен домен, имхо.

Попробуйте из командной строки удалять командой
del /f/q *
Я временные папки всегда так чищу (там обычно скапливается куча файлов) - она работает на порядок быстрее, чем проводник.
Удобно запускать команды оболочки из какого-либо файлового менеджера, из Far manager например.

Возможно корпоративный прокси с прозрачной авторизацией через АД.

Любой легковесный линукс и RDP клиент.

Потому что у вас вызов java ... стоит в операторе if.
Я не понял что вы хотите этим сказать.
В любом случае это не корректно - if не может вызывать внешних программ как в bash.
О чем и сообщается в ошибке, правда ошибка может показаться несколько нелепой на первый взгляд, но на второй уже все нормально :-)

"Локальной сети нет" - это обычно не верное утверждение.
Возможно вашим WiFi пользуются соседи: пора сменить пароль, включить WPA2 и выключить WPS.