По ряду причин очень сомневаюсь, что вот так просто, некими магическими пакетами можно сделать DoS для 2012-го сервера. Но на всякий случай поставьте все обновления из Windows Update.
Если я правильно понял, проблема выглядит так: по вечерам перестает ходить трафик между 2012-м и интернетом, а если вместо 2012-го включить ноутбук, трафик нормально ходит в любое время?
Собственно, информации мало для диагностики. Попробуйте в момент "падения" интернета сделать трассировку типа tracert 8.8.8.8 и посмотреть, на каком узле она рвется. Попробуйте записать таблицы маршрутизации и настройку IP для ноутбука и 2012-го до падения интернета и 2012 после падения интернета, чтобы потом их сравнить. Можно еще arp-таблицы посмотреть, может, кто-то спуфит arp, хоть и не уверен, что это возможно на GPON. Записать эти данные можно, сделав:
ipconfig /all >> c:\ipconf.txt
route print >> c:\route.txt
arp -a >> c:\arp.txt
Кроме этого, посмотрите, что в регистрируется в событиях на 2012-м в момент падения интернета.