ну вот представь ситуацию, что ты свою задачу "PRJ-3" не смог с одного коммита сделать (а такое случается довольно часто). и вот у тебя образовалось 20 коммитов с комментом "PRJ-3". и ты там много чего переделывал и теперь опять что-то изменилось и тебе нужно посмотреть одну из первых реализаций задачи. ты помнишь, что она где-то в начальных коммитах, но не помнишь в каком. вот тебе и придется сидеть и открывать по одному эти коммиты и смотреть тот это или не тот.
а были бы комментарии нормальные - ты бы это увидел по ним и лишних движений бы не было.
p.s. а когда с момента реализации прошла неделя, месяц, год - ситуация усложняется в разы. потому что тут уже ты и сам не будешь помнить что и когда ты писал.