Сначала объедините все ваши строки в одну через какой-то раздилитель, которого не может быть в искомой строке (можно и без него, но с ним код чуть проще будет). В конце поставьте этот же разделитель 2 раза. Вроде "строка1$строка2$строка3$...$строкаN$$".
Вот уже ваша задача - быстро искать какую-то остроку в фиксированном тексте, а не куче строк.
Тут есть много вариантов. Например, постройте суффиксное дерево алгоритмом Укконена. Вот эта ваша структура. При запросе, как в боре, поищите искомую строку в этом дереве. Если где-то перехода нет - вхождения вы не нашли. Если вы остановились на какой-то вершине (или ребре в дереве), то вам осталось каким-нибудь обходом в глубину найти все листья в поддереве этого места. Каждый лист соответствует вхождению. Еще при построении суффиксного дерева вы каждый лист пометите началом суффикса. Можно в тот же момент место в строке и конкатенаций перобразовать в номер исходной строки (например, бинпоиском по индексам начал строк в тексте. Или просто заведите массив, где для каждого символа в тексте при построении запишите, какая изначальная строка там была).
Если разделитель не использовать, то могут быть лишние результаты - где искомый шаблон приложился между двух исходных строк в тексте. Их надо будет выкинуть.
Другой вариант - через преобразование
Барроуза — Уилера. Вот есть
лекция. Этот алгоритм часто упоминается в курсах по биоинформатике. Реализацию может даже найдете где-то. Потом можно найти номера исходных строк из индексов вхождений через тот же бинпоиск по сортированному массиву индексов начал всех строк в тексте.
Да, проблема тут будет, если у вас шаблон короткий, то вы найдете все вхождения, включая повторы в каждой из исходных строк. Тогда эти алгоритмы могут работать не сильно лучше наивного.
Учтите, что построение структуры данных тут будет в несколько раз медленнее простого for+Contains. Выигрыш вы получите, если у вас текст действительно статичный и вы в нем много раз что-то ищите.