Владимир Муковоз

в начале файла добавить #!/usr/bin/env python
и сделать chmod +x script.py

while [ ! -f имя.файла ]; do
  sleep время
done
cp

Без точки и в корневую. Проверьте в консоле разработчика, вкладка network что бы скрипт действительно делал запрос.

См. ответ nexthop

Или

1. Составьте список файлов и их контрольных сумм.
   
2. Напишите скрипт, который, используя md5sum выполняет по этому списку сверку контрольных сумм
   
3. В случае несовпадения сумм - оповещение администратору и halt сервера
   
4. Стартовать скрипт при запуске сервера
   

как то так
cat FileOne | ssh [user]@[server] 'tee -a /path/FileTwo'

CloudFlare это компания предоставляющая услуги в области IT безопасности. В том числе в области защиты от DDoS. Защита осуществляется технически с помощью CDN. Вы делегируете управление вашим доменом на сервера CloudFlare, они гонят весь трафик через свою CDN и proxy сервера, анализируют его и при необходимости блокируют.

CloudFlare - это... действительно чудо) в хорошем смысле слова. Но не хостинг.

Это сервис, который защищает ваш сайт от зловредных запросов, да и не только от них. По сути, этот сервис выступает в роли прокси-сервера.