VoidVolker

Разместить с каждой стороны по пустой ячейке. Или просто заглянуть в исходник страницы.

Вообще-то текст не прыгает, а тоже увеличивается, ведь это трансформация всего блока вместе с содержимым. В данном случае, если не хочется изменять размер текста, то следует изменять размер блока:
https://jsfiddle.net/o3sjsmhk/

Как построить грамотную структуру?

Так же как и всегда: сделать декомпозицию задачи на более маленькие подзадачи/модули и так разбивать до самого низа. Например, взять какую-либо утилиту для рисования диаграмм и на диаграмме отобразить взаимоотношения модулей. Вот мой пример из реальной жизни: