По ходу дела разберёшься. Больше записывай. Желательно схематично. Что сделали, что необходимо сделать. Какие зависимости. И т.д.
Всё должно быть перед глазами.
Не обязательно с помощью софта. Начни с обычного блокнота и ручки. Со временем будет подбираться софт. Всё очень индивидуально.