Realetive

Подключите скрипт AjaxForm c defer после JQuery.

Если я правильно понял (очень туманно расписано то, чем отличается получаемый результат от желаемого), вам нужно указать во втором блоке в параметре &startId номер документа, соответствующего разделу «О компании», т. е., например, если он равен 14, то:

[[Wayfinder?
  &startId=`14`
  &level=`1`
  &limit=`0`
]]

Если у админа есть доступ в админку, то можно реализовать через TV, настроив (по желанию) источник файлов, указав конкретную папку для загрузки, чтобы избежать мешанины:

Список источника файлов:


Параметры источника:


Пример использования в документе:


Для автоматизации процесса можно воспользоваться платным расширением для MODX: ms2Gallery (990 руб.) — оно позволяет работать с изображениями и ".pdf-файлами тоже.

Если есть необходимость загружать файлы с фронтенда, можно использовать хук для FormIT, можно, опять же, установить платное дополнение Uploadify (490 руб.).

Но ваш вопрос, в целом, очень обширен, по этой теме можно целую статью написать, а это выходит за рамки формата Тостера.

Можно сделать на базе интернет-магазина. Книга становится товаром, автор — производителем. Советую посмотреть сторону miniShop2 (документация).

«Склейте» все css-файлы в один, удалив перед этим неиспользуемые стили. Не самая лучшая практика, но на начальном этапе вполне подходящая — специальный модуль для MODX от bezumkin: MinifyX (документация).
P.S. Более корректно делать это на рабочей машине, на которой ведётся разработка (до выгрузки на сервер), например через Gulp.js, но это тема отдельного разговора.

Если вы используете miniShop2, лучше использовать инструменты, предложенные самим разработчиком — расширение свойств товара. Можно также использовать связи товаров. Полученную логику потом несложно обернуть в производные pdoTools, чтобы получить требуемый результат. При достаточном опыте разработки на MODX также возможно добавить и обновление данных без перезагрузки страницы (AJAX).

Есть. Автор — Илья Ершов
Описание
Исходники

Самый очевидный способ — использование событий MODX. В скрипте, осуществляющем обработку данных заказа, создаёте собственное событие и уже через плагин отправляете уведомление:

$modx->getService( 'mail', 'mail.modPHPMailer' );
$modx->mail->set( modMail::MAIL_BODY, 'Привет' );
$modx->mail->set( modMail::MAIL_FROM, $modx->getOption( 'emailsender' ) );
$modx->mail->set( modMail::MAIL_FROM_NAME, $modx->getOption( 'site_name' ) );
$modx->mail->set( modMail::MAIL_SUBJECT, 'Новое письмо с сайта «' . $modx->getOption( 'site_name' ) . '»' );

$modx->mail->address( 'to', 'vasya.pupkin@pochta.ru' );

$modx->mail->setHTML( true );
if ( !$modx->mail->send() ) {
  $modx->log( modX::LOG_LEVEL_ERROR, 'Ошибка при отправке письма: ' . $modx->mail->mailer->ErrorInfo );
}

$modx->mail->reset();

miniShop2 тоже хорош
Документация
Демо

Какая версия MODX? Сжатие js и css в настройках отключено?

Всё зависит от того, как вы создавали эти поддомены. Это привилегия сервера, а не движка, поэтому однозначного решения быть не может. Если каждый поддомен имеет свой контекст в админке MODX, то тут проще — вы можете получить список всех контекстов и на основании их имени или base_url сформировать ссылки:

<?php
$contextKeys = array();
$contexts = $modx->getCollection('modContext', array('key:NOT IN' => array('web', 'mgr')));
foreach ($contexts as $context) {
    // получение ключа каждого контекста
    $contextKeys[] = $context->get('key');
}

Зависит от логики фильтрации. Для фасетной лучше использовать mSearch2. Если логика более простая, то можно передавать ключ фильтрации через GET-параметр и уже в самом сниппете использовать условия в зависимости от [[#GET.ключ]] (если вы используете pdoTools, значит fastField у вас, скорее всего, включен).