1. Администрировать один сервер терминалов проще чем десятки компов в удаленных офисах. Если нужно обновить платформу, то делается это на сервере за 15 минут. А на всех клиентах 15*n если не настроено или не сработало автообновление от 1с.
2. Лицензии раздавать возможно проще. Ключи воткнуты в основном офисе все, для удаленных не требуется возить туда ключи и распределение их будет более грамотным. Хотя ключами может и сервер 1с управлять, тут нужно смотреть.
3. Про трафик уже сказали, но в принципе тонкий клиент может и немного потреблять, с учетом заданий на печать даже значительно меньше.
4. Если вдруг нужно запустить какую-то базу файловую, то на rdp это легко.

Насколько я понимаю удаленные офисы подключаются к терминальному серверу и запускают 1с там.

Стандартная ситуация. Возникает в связи с традицией иметь системный диск и диск с данными. Раньше люди часто ОС переставляли и считалось хорошим тоном данные на втором логическом разделе иметь.

Решение очень простое.
1. Переносите все данные с диска D на любой носитель (соседний комп, внешний диск).
2. В оснастке "управление дисками" выбираете диск D и удаляете его. Правой кнопкой мышки, удалить том. Должно образоваться "не занятое место" с черным окрасом.
3. Там же, на диске C, жмякаете правой кнопкой - расширить диск и указываете на сколько его нужно расширить. Рекомендую на все имеющееся пространство, и обходиться без диска D в дальнейшем.
4. Возвращаете ваши данные с внешнего носителя на диск C в какую-нить папку.

Это работает если вы не ставили на диск D всяких программ через установку удаление, процесс не требует особых навыков и сторонних утилит. Если такой способ не подходит, то есть всякие загрузочные диски со всякими утилитами для переразбивки дисков.

С одной стороны в любой офис где больше 5 ПК и нужны хоть какие-то ограничения по доступам уже можно ставить AD. Когда-то у МС были примерно такие рекомендации. И были сервера foundation до 15 пользователей с ценой как десктоп. С другой... сейчас ставить МС не модно. Нет, если навыков по другим продуктам мало, если за пиратку не переживаете, то все можно. И подняв на МС уже переползать на другие продукты в чем-то проще. Тем более что у вас уже везде на ПК винда стоит, винсервер будет быстрее внедрен.

Если не заморачиваться по виндовым продуктам, то можно просто поставить хранилку NAS (можно самопал на truenas), там обычно есть Samba. Насколько я помню она позволяет поднять домен и запихнуть туда компы и пользователей, распределить права доступа. Там нет GPO и много чего еще. Заодно будет иметь рейд и бекап на диск со снепшотами. Все это с красивым веб интерфейсом и без возможности стрельбы в ногу. Можно и без заведения компов в домен. Просто подключить нужные сетевые диски каждому пользователю под его учетными данными созданными в NAS.

Бухам действительно нужно отдельно жить, только не сеть отдельную, а просто отдельные папки с их данными и 1С. Чтобы никто кроме них туда не лез. И даже папки баз 1С нужно разграничивать, часть сотрудников пойдут в УТ, бухи пойдут и в УТ и в БП, часть бухов пойдут в УТ, БП, ЗиК.

Сеть пока плоская, с одной подсетью. Ну если видеонаблюдение будет, можно вывести в доп сеть.

По урокам не знаю, раньше можно было почитать рекламные буклеты|сайты где расписано как классно вы заживете купив тот или иной продукт. Ну и дальше уже пытаться внедрить описанные решения приближая действительное к желаемому. Рекламные материалы по тому как лучше обустроить SMB сегмент в интернетах валяются, ищите. Ключевые слова SMB, small business, soho server. Есть учебные курсы по тем или иным продуктам у вендоров. Тыкаетесь, понимаете какие вас беспокоят проблемы, понимаете какие вопросы нужно решить, находите продукт закрывающий проблему, обучаетесь по этому продукту, внедряете, следующая итерация.