Всеё банально просто. Java компилируется в байткод, а не в ассемблер. Байткод интерпретируется виртуальной машиной JVM, которая при необходимости делает компиляцию в нативный код процессора (технология JIT - Just-in-time compilation).
Другими словами, для того чтобы получить нативный код нужно запустить байткод внутри JVM. Именно поэтому никто не пришет на java драйверов и прочей низкоуровневой хрени. С другой стороны, чтобы эту хрень писать на java, нужно чтобы было одно из двух условий:
1) либо процессор напрямую поддерживал спецификацию JVM (со всем барахлом типа GC, memory allocation^ resource management)
2) либо операционная система поддрерживала в ядре спецификацию JVM (с тем же самым барахлом)
Ну и не нужно говорить, что язык барахло, если на нем нельзя писать драйверы и секции для MMU. Есть еще десятка два языков, которые это не поддерживают, например все X.NET или erlang^ python и т.д.
Java для прикладного программирования, а C/C++/D/ASM и прочее - для машинного.
