ищет и проверяет пароль пользователя в ОС
Пользователь ОС не имеет совсем ничего общего с пользователем в БД.
Просто обычно когда ставишь Vesta там более поздней версии стояла. И приходилось ручками обновлять до php 7, а сегодня поставил смотрю php 7.4 стоит.
настройка субд это вероятно innodb_change_buffering=none
А что имеется в виду под опциями монтирования? там вроде про отказоустойчивость нет, выбираю тип ФС и режим чтения.
опции ускорения типа кэшей всяких отключаются
Хотите сказать эта проблема не такая уж и проблема?
Создали файл - это уровень файловой системы. LVM - уровень блочный. Если вы меняете данные на блочном уровне - файловая система может на это реагировать аномально, т.к. предполагает что блочное устройство на котором размещена меняется монопольно этой файловой системой. Вы как root системы можете игнорировать эти ожидания программ, но все фейерверки - это уже ваша ошибка будет.