АртемЪ

почему все молчат?

А что по вашему все должны говорить на эту тему?

В последние дни в сеть сливается бот-сеть с проксями

Ну и пусть сливают, что в этом такого? Вам не нравится сам факт существования такой сети, или тот факт что происходит слив?

Такого добра как прокси в сети всегда хватало.

любой школьник может организовать DDoS атаку

Ничего подобного.
Атаку может организовать только владелец ботнета. Школьник то каким образом тут?

Все приложения которым вы явно укажете работу через прокси будут работать через него, остальные будут работать напрямую.

Разрешите трафик на прокси на фаерволе, и запретите весь остальной трафик.

У вас похоже неправильный подход, мониторинг такого уровня, для разруливания данной ситуации просто не нужен.

пропускную способность канала увеличили до 15Мбит\сек, однако это не решило проблему медленной скорости приложений требующих соединения с интернетом

Надо понимать, что у разных приложений разные требования. И далеко не всегда нужна именно пропускная способность канала.
Например RDP может очень быстро работать работать на канале 256Кбит\с и ужасно тормозить на канале 100Мбит\с. Поэтому что для этого приложения важна задержка - тут надо пинг смотреть, и приоритеты настраивать, а масштабирование ширины канала тут никак не поможет.
То же самое касается большинства программ удаленного доступа, голосовой связи.

Все остальное - либо подключаем канал достаточной ширины, чтобы все пролазило, либо настраивать шейпинг, по пользователям, либо по приложениям, тут уж от требований конкретной ситуации зависит.

Зачем такой анализ того, кто куда, и когда ходил, и какую нагрузку создавал в конкретный момент времени?

Имеется машина под Windows Server 2008, которая работает на прием/раздачу интернета. Конкретно идет прием 3g сигнала с модема, затем идет раздача по ethernet в wan порт роутера, который раздает инет уже по WiFi.

Удивительная конструкция. Обычно это делают на роутере. Но чтобы на сервере, да еще и под windows...

Необходимо ограничить доступ к некоторым ресурсам для беспроводных пользователей, для этого была поднята и настроена прокся.

Ну настройте этим пользователям интернет через проксю через доменные политики и все дела.

и в итоге окажусь виноватым я? или это не так работает?

Работает это не так.

Если вы оказались на месте преступления в момент его совершения, это не значит что вы будете виноваты.
Это значит что скорее всего к вам будут вопросы. Только и всего.

То же самое и с прокси.

Я правильно понимаю, что админ сможет увидеть только то, что с моего компа идёт какой-то шифрованный трафик на ip прокси сервера и всё?

Нет, не правильно.
Админ может видеть куда вы ходите, и через какой прокси. С чего там трафик должен быть зашифрован?
А даже если бы вы его и зашифровали - что с того?

Для этого нужно две вещи-
1)Наличие белого(реального) IP адреса.
2)Программа прокси сервер под вашу операционную систему, коих множество что под винду, что под линукс.
Вот и все.

Указать компьютер с прокси как шлюз.

Вариантов больше не вижу.

А вырубить в настройках подключения ipv6 не вариант?

Вполне.
Только такая связка менее анонимна чем просто TOR, ибо отследить через VPN можно, например по оплате.

Я ничего не смыслю в этом и опасаюсь, что это на самом деле какая-нибудь адская смесь, которая не повысит вероятность не-идентификации меня, а наоборот снизит.

Так и есть.
К тому же если вы в этом ничего не смыслите, вы оставите столько следов, что найти вас большой проблемы не составит.
Хотя принцип Неуловимого Джо еще никто не отменял, и он прекрасно действует в большинстве случаев.

Возможно если настроите.

Насколько я понял, пустить headless браузер через определенный tun-интерфейс не представляется возможным

Можно, но сложно. Указывайте маршрут на адрес через интерфейс.

зато возможно создать несколько прокси, каждый из которых будет ходить через один из этих интерфейсов

Все точно так же как и в случае с браузером, указываем маршрут на конкретный прокси через нужный интерфейс.

Подскажу по секрету, надеюсь не будете об этом много болтать, мне самому это по большому секрету сообщили.
Есть такой малоизвестный сервис - yandex.ru
Аккуратно заходите на этот сервис, вбиваете ваш запрос "Прокси с Московским IP" и этот сервис выдаст вам кучу ссылок на сайты предоставляющие прокси с Московским IP.
Но никому ни слова об этом сервисе!

P.S. есть еще один сервис, но тот насколько секретен, что я не могу вот так, вот его назвать, могу назвать только первые три буквы -goo

Если вопрос только в раздаче адресов - без проблем.
А вот прогнать трафик от 150пользователей - ну это будет зависеть от объема, скорости и качества трафика.

Как сделать из телефона прокси сервер?

Очень просто.
1)Получите белый IP адрес.
2)Установите прокси сервер на телефон.

Объясните, как можно реализовать что-то похожее на mbmproxy.com.

Берете обычный прокси сервер, прикручиваете к нему биллинг, и пожалуй все.