Да, после возврата средств работа удалится из профиля, то есть в списке выполненных вами контрактов, который есть в вашем профиле, показываться она не будет. Но ваш Job Success Score все равно упадет, и точной причины я не знаю - либо он упадет из-за самого факта возврата средств, либо скрытый отзыв, который оставляет клиент (там, где он оценивает вас по шкале от 1 до 10 в плане того, рекомендовал бы он вас как исполнителя другим клиентам) вносит свои коррективы.
Вообще многие советуют в своем отзыве подробно описывать почему заказчик неадекват, и средства сохранять, если там приличная сумма: во-первых чтобы он не привыкал к мысли, что можно и работу получить, и денег не заплатить, а во-вторых это ваши деньги всё-таки.