Не посылайте весь трафик внутрь впн. Тогда всё будет работать.
Если же какой то сервис надо внутрь впн запихать - то установите например lxd контейнер, в него засуньте сервис и ваш впн.
Тогда контейнер будет работать через впн подключение, а сам сервер - как обычно