Потому что дефолтный маршрут (маршрут по умолчанию) уходит в VPN-туннель. Когда вы пытаетесь подключиться через ssh, то ответный трафик уходит в туннель, на другом конце туннеля NATится и возвращается к вам от левого адреса (не от того, на который вы подключаетесь по ssh).
Возможно необходимо прописать какие-то правила в iptables?
Разве что через iptables покрасить (маркировать) ssh-трафик, и потом на основе покраски маршрутизировать его мимо туннеля.
Где-то там должны быть примеры:
https://www.google.com/search?q=iptables+mangle+ma...