- гипервизор на raspberry (3я модель, не 4я), вы серьезно?
- заморачиваться (читай покупать почти домой) с KVM сильно дороже самой платы = лишено всякого смысла
- касательно "порчи ОС" софтом и его настройкой: например, всякие панели управления (VestaCP и т.д.) требуют перед установкой чистой ОС, потому как скриптам (да и человеку, насколько я понимаю), быстрее переустановить ОС и поставить панель с нуля, нежели разбираться с конфигами уже установленного и настроенного ПО