упарываться по безопасности и давать возможность видеть пароли открытым текстом - противоречащие друг другу задачи на общем уровне.
на продвинутом уровне это вполне решается шифрованием, если способны обеспечить безопасность ключа.
но при подобной постановке вопроса в этом есть обоснованные сомнения.
элементарно: не завязываться на ид.
у любого элемента на странице всегда будет какой-то уникальный для него параметр: специфический атрибут/положение относительно родителя(ей)/и всё такое.
всё это элементарно решается икспасом, если в него уметь.
1. решать вам.
если считаете, что есть что показать, стоит.
если считаете иначе, не стоит. или пользуетесь приватными репо.
2. решать вам. обычно в репо хранятся только необходимые для сборки файлы.
3. гит - не лучшее место для хранения бинарников. но можно.
сделайте инвалидацию кэша и перезапустите шторм.
если не помогло, отключите все плагины и перезапустите шторм.
если не помогло, то полное удаление шторма и переустановка.