http://tourshop.online/.well-known/acme-challenge/AAABBBCCC........ZZZ (имя файла и его содержимое - случайные наборы символов, определяемое сервером Let'sEncrypt). И если файл существует, и Let'sEncrypt его получает, и в нём то содержимое, которое ожидает Let'sEncrypt - то CHALLENGE успешен, SSL-сертификат выдаётся. Копайте в эту сторону, например в логах NGINX должно быть успешное обращение к файлу в директории /.well-known/acme-challenge/...
и второй с редактированием, хранящийся где-то ещё, на который и указывает ссылка из "Последние файлы".