Поставил 2x120 ГБ в RAID 1, примонтировал корень в папку с файлами БД.
Нагрузка упала с 95-97% до 2-4%, работают год, всё ОК.
tmpfs (сейчас именно оно актуально) довольно опасно, но зависит от того, какие у вас данные, и на сколько критична потеря данных за определенный промежуток времени.
К стати, полный дамп делаю каждые 15 минут на второй RAID 1 с пары HDD, мало ли чего)