Все что поступило на ваш расчетный счет это доход.
Вам поступил миллион, вы взяли свои 6% и заплатили налог с миллиона, потому что не смогли подтвердить расход.
А расход подтвердить в вашем случае будет не просто.
Чтобы платить налог со своих 6% вам надо агентские услуги - тогда все отлично. Нужен грамотный бухучет. Малейшая ошибка в учете и опять же придется платить налог с суммы поступления.
В идеале не принимать никаких оплат, кроме вознаграждения на свой расчетный счет, все проводить через банк по договору. Но это если с банком договоритесь.
если я напишу что мой сервис занимается автоматизацией пожертвований я свободен от налогов ?
Различного рода надписи на сайте и на заборе никоим образом не влияют на исчисление и уплату налогов. Можете с тем же успехом слово из трех букв на сайте написать, результат будет тот же.
По поводу регистрации - либо регистрируетесь как ИП, либо открываете юрлицо.