Организатором распространения информации в сети Интернет является лицо, осуществляющее деятельность по обеспечению функционирования информационных систем и (или) программ для электронных вычислительных машин, которые предназначены и (или) используются для приема, передачи, доставки и (или) обработки электронных сообщений пользователей сети Интернет.
То есть если мессенджер используется не в интернете, а только в частной сети, то тогда это не считается за ОРИ.
А ещё есть такой пункт:
Обязанности не распространяются на операторов государственных информационных систем, операторов муниципальных информационных систем, операторов связи, оказывающих услуги связи на основании соответствующей лицензии, в части лицензируемой деятельности, а также не распространяются на граждан (физических лиц), осуществляющих указанную деятельность для личных, семейных и домашних нужд.
Дипломная работа или пет проект вполне подпадают под личные нужды, но на всякий случай напиши обращение в РКН, чтобы они это подтвердили и показывай официальный ответ, если будут вопросы у кого-то.