Палка может быть о двух концах - как контроллер может иметь ограничения и работать только с "фирменными" дисками (читай - "с кастомными прошивками от производителя хранилища"), так и диски могут быть предназначены только для определённых в том или ином роде стораджей.
Задача по перепрошивке дисков (смене одной firmware на другую) разнится по сложности в зависимости от пары "что есть - что нужно", но в большинстве случаев находится в диапазоне от "сложно" до "очень сложно". Производителям, в конце концов, нравится, когда диски покупают только у них по не самым низким ценам.
В качестве отправной точки вы можете попробовать проверить диски с помощью
R.tester'а, он скорее должен их увидеть, чем нет, но это зависит от драйверов контроллера.
Кроме того, с этой же целью вы можете попробовать подключить диски к "контроллеру общего назначения", наподобие LSI и попробовать сделать тест на нём.