Системному программированию? Да, базовые знания приобретете, собственно, изучите POSIX api, который в большинстве своем полностью идентичен для всех юниксов. Сможете писать утилиты и демоны, обмениваться данными через сокеты, каналы, сообщения и общую память, синхронизироваться через мьютексы и семафоры. Точно пойдет на пользу, так как будете знать, что за неонка у них внутри. Более того, эти примеры скорее всего будут работать и в линуксе. Например библиотека winsock полностью повторяет posix, и если из нее использовать только posix-вызовы, то ваша программа будет работать и под виндовс и под любую posix-совместимую систему.
Однако, в каждой системе существуют еще с десяток, если не сотню, собственных механизмов на всякие случаи. Вот с ними придется разбираться отдельно для каждой системы, но это уже специализация.
Стоит ли изучать? Точно стоит, и эти знания не пропадут даром. Все юниксы достаточно похожи, изучайте!
Добавлю, вот ядра и внутренние механизмы у разных юниксов могут различаться, причем радикально, особенно то, что касается драйверов, расширений самого ядра и его окружения.
Ну и само утверждение немного лукавое, и да, и нет. Дьявол в мелочах, увы.