Какое из шифрований "менее нагруженное" и шифрует быстрее кто знает? Есть программа CryptSync, она поддерживает: IDEA, 3DES, CAST5, BLOWFISH, AES, AES192, AES256, TWOFISH, CAMELLIA128, CAMELLIA192, CAMELLIA256
хотелось бы не заморачиватся и выбрать максимально быстрое
AES-256 обычно поддерживается всеми современными CPU и при наличии аппаратного ускорения в программе скорость шифрования будет равняться сотням мегабайт или гигабайтам в секунду. Про AES-192 не помню точно. Возможно, тоже. Также, возможно, Blowfish и Twofish.
Тут скорее надо узнавать, какие шифры используют аппаратное ускорение в упомянутой вами программе.