Первое с чего стоит начать - забыть про MVC микро фреймворки аля Ларавел / Yii и т д.
Если Ларавел это быстрый истребитель, то в сравнении с ними WP - это авианосец. Который может на своем борту нести функциональную нагрузку как 100 Ларавелов.
Отсюда разница в архитектуре - у WP она в разы толще. Ее изучить в разы сложнее.
Поднять сайт на WP может школьник без подготовки. Однако когда встает вопрос каких то разработок - WP в разы сложнее.
И самое главное - в нем реализованы все парадигмы ООП. Самое важное - это принципы компоненто ориентированной разработки. Которые базируются на Event Driven архитектуре. Это то о чем говорил Ален Кей 20 лет назад и назвал это ООП. Но лишь единицы во всем мире поняли что он имел ввиду. И WP это одна из не многих платформ которая сумела эти идеи реализовать правильно. Вся ее разработка базируется на обмене сообщениями - через хуки. А вся логика бьется на компоненты.
Там есть место MVC, но то как там это работает ни капли не похоже на MVC аля Laravel/Yii ...
Потому самое главное забыть про принципы Laravel и прочих модных течений MVC. И погружаться в архитектуру, которая покорила мир. Благо статей навалом. Стартовать можно вообще с пеленок. Но чтобы стать профи в этом деле - нужны годы практики. Хороших спецов в этой теме единицы.
