Портфолио - это Ваши работы. Что потом с ними сделал заказчик это уже отдельная история. 
Иногда выкладываю в портфолио варианты, которые заказчик не принял или заставил переделать в соответствии со своими представлениями. Или несколько вариантов, которые были предложены. 
Но (!) в договоре есть строчка, что имею право выкладывать работы в портфолио. 
Если заказчик заранее попросил этого не делать, то естественно такие работы никуда не идут. 
Еще может быть несколько типов портфолио: публичное и приватное. Т.е. то, что лежит в открытом доступе или то, что показываю при встрече или по запросу.