Если программа понятия не имеет как работать с SHA256, а обновлений нет - вероятность что она не сможет работать с сервером по безопасному каналу 100%.
И если яндекс не разрешает подключения по POP3/IMAP4 без ssl - стало быть да - забирать и отправлять почту в вашем клиенте будет невозможно.