В общем удалось решить вопрос с помощью программы BlindScanner, установил её как сервер на удаленную машину с Windows 8.1 и подключенным по средствам USB сканером. И как клиента на свою машину с Ubuntu 14.04. Прекрасно работает, результатом доволен, дополнительные функции радуют.