Литературу, это позже. Тебе надо самое базовое сейчас. А литературу нужно читать вдумчиво. Смотри видео, где показывают - как, что делать.
Все в *nix начинается с комманд man и info.
Здесь философия в начале книги, прочитай:
Essential System Administration, 3rd Edition
shop.oreilly.com/product/9780596003432.do
Здесь для озарений:
Unix Power Tools, 3rd Edition
shop.oreilly.com/product/9780596003302.do
В любом случае, со временем, тебе надо взять суть : те, принципы работы с системой и системы. Тогда все покатится, как по маслу.
Основной принцип imho: мелкие, простые комманды, ты как волшебник - соединяешь в мощный функционал операционки.
Удачи, Люк!
update:
по сути, чтобы давать комманды системе, тебе нужно знать как работает твоя коммандная оболочка ( например, у меня bash ), соответственно я смотрю man bash - если встречу что-то странное.