Нужно смотреть по пиковой нагрузке всех ядер.
Если оба процессора нагружаете в ширь, то потеряете в производительности при многозадачности, поменяв L5630 на E3-1275L.
Если у вас нет нагрузки на все ядра, то вам будет предпочтительно поставить E3-1275L (или, вообще, никакой разницы, можно просто убрать лишний проц.), просто для уменьшения числа железа и питания к нему.
Материнская плата B85M-G свежее и в ней имеется Sata 3, pci-e 3.0 и usb 3.0, в текущей материнской плате все это на версию ниже.
Sata 3 немного оживит дисковую скорость, сделает ее максимальной для HDD, но если вы используете RAID массив, то непонятно, насколько надежен RAID на не серверных платах. Если у вас нет RAID массива, и не планируете, то можно десктопную материнку использовать.