* http (лучше https но тогда нужен на машину источник файлов а это значит + домен либо самоподписанные сертификаты) с авторизацией
По этому протоколу можно работать откуда угодно, но с каталогами будет неудобно
Промежуточный вариант webdav, это надстройка над http, но поддерживается майкрософт вплоть до монтирования в файловую систему и работа из проводника
* scp (штатный механизм ssh) - самая простая настройка для сервера, наиболее надежный (встроенное шифрование и сжатие трафика), но нужны клиенты с поддержкой scp (все популярные файловые менеджеры умеют, типа far commander или total commander)
Есть еще sftp, он немного отличается как более продвинутый (под linux есть fuse модуль для монтирования его в каталог), реализация идет штатно с ssh (ну или я привык что такие вещи в linux легко) так же поддерживается популярными клиентами работы с файлами
* любые инструменты синхронизации, когда вместо доступа к файлам по какому либо протоколу, они копируются и синхронизируются автоматически таким образом что размещены на всех машинах где нужен доступ.
Собственно все популярные централизованные системы типа dropbox/Google Drive/OneDrive и т.п. работают по этому принципу, но в довесок данные копируются еще и на сервера компании этого инструмента.
Я рекомендую использовать открытый проект Syncthing - он не копирует файлы ни на какой сервер, и поддерживает любые ОС от windows до android (очень прикольно настраивать синхронизацию через промежуточное устройство типа смартфон, позволяющее синхронизировать файлы между закрытыми сетями)