Там, обычно, предусмотрена защита от дурака. То есть, не получится вставить в данный разъем неподходящий к нему штеккер. Они по форме разные. По разному компонуются (если разъем составной (состоит из двух стыкуемых вместе частей)).
Дополнительное питание идет для мощных потребителей. Помимо основного разъема БП (многоконтактного), дополнительный идет к процессору, на внешнюю видеокарту.
Вообще, если БП современный, мощный (расчитан на современные реалии энергопотребления) и не из самых непонятных нонеймов, то и разъемы соответствующие должны быть в наличии. По стандарту данного конструктора (IBM PC).
Если про питание дисков, шины SATA, то, по-моему, да, есть переходники: molex (белый, 4 контактный) -> sata. А вот есть ли обратный - не знаю. Вполне вероятно что да. Переходников каких только не бывает. Тем более, если параметры там одинаковые по напряжению, проводам. Просто другой тип разъема. Более компактный, современный и прочее.
Вообще, к компам обычно дают инструкцию, как правило, на английском языке, где многие вопросы (что?, куда? и зачем?) объяснены. Но которую, обычно, всем лень читать. :)