Например, в бесплатном GIMP есть фильтр шумов
https://thegimptutorials.com/how-to-reduce-noise
В пиратском Photoshop (ну куда без этого варианта? =D) есть обычный фильтр, удаляющий шумы, и новые нейронные фильтры, делающие всё практически одной кнопкой.
Всякие онлайн-сервисы, которые видел, либо не делают ничего полезного, либо имеют лишь урезанный триал-функционал с платным доступом к остальному.
Вполне вероятно, что существуют отличные бесплатные инструменты по удалению шумов, но на фоне имеющихся редакторов основная масса пользователей на них внимания не обращает.