Привет.
Да, csv это текст с разделителем, но мы загружаем на сайт файлы, записанные в нем. То есть если мы напишем index.php и запишем туда какую-нибудь белеберду, то это файл с белебердой будет хранится на сервере.
Мне интересно какие именно атаки могут произойти(SQL-инъекции, или XSS-атаки или еще что-то)
Отталкивайтесь от максимально возможного риска, что в данном случае будет шеллом (в идеале - однострочником). Ну и, в зависимости от реализации/обстоятельств, можно ещё на CSV-инъекции обратить внимание.
В остальном - зависит уже от конкретных деталей реализации этого функционала.