Cовершенно непонятно, зачем тут lvm в принципе?! К тому же мне кажется у тебя lvm создан не на диске а на разделе, что в принципе бред (изначально lvm это система над блочными устройствами, как инструмент их управления, кстати не шибко удобный, например чтобы можно было расширить диск, добавив к нему еще один физический).
Настоятельно рекомендую избавиться от него полностью., тем более у тебя виртуалка!
Покажи что выдают
fdisk -l /dev/vda
pvdisplay -m
lvdisplay -m
показывает что 3 раздел 98 гигабайт? (судя по скрину да но хз, lsblk кажется показывает не ту информацию)?
Если да, то это значит lvm уже увеличился до нужного размера, и дальше нужно просто увеличить файловую систему до нужного размера
Если файловая система ext2..4 то достаточно прописать resize2fs (причем кажется оно давно умеет это делать на лету без отмонтирования диска)