В Индизайне сайты не рисуются, а верстаются (графически, а не в хтмл). Индиз как ЦМС - в нем собирается сайт. Если сайт небольшой, то в индизе сложнее возиться, а если у нас 50-100-200 страниц с разным индивидуальным контентом (текст, графика), то его способности обрабатывать такой объем очень пригождаются. Выравнивание по пикселям и масштаб настраиваются через скрипты.
Так же полезен для командной работы нескольких дизайнеров и редактора-копирайтера одновременно.
Ссылку уже давали, но не лишне повторить:
www.ivanya.ru/indesign