Какие именно баннеры?
Можно попробовать создать блок, расположить его в нужном месте, и там вставить баннер из базы данных. В базе может быть ссылка на изображение, например.
Сделайте его как обычное окно, установите в нем крестик, при котором оно будет скрываться. А потом при нажатии на крестик скрывайте его с помощью jQuery.