Если честно, то никогда об этом не задумывался.
Но если используете <![CDATA[]]> то думаю можно и оставить, ведь не принципиально какие теги вы передаете, другой вопрос что я не могу со 100% уверенностью ответить покажет ли ее rss ридер
На сколько помню там люди начали проверять что из себя представляет контора, и по этому поводу был небольшой срач, последние комменты я не читал, так что не могу сказать чем все закончилось.
Не вижу особой проблемы, один объект — это запись в wordpress, у которой есть параметры допустим как в примере (город, метро и пт), которые задаются в таксономии записи и соответственно по которым и идет фильтрация. Через custom fields задаются координаты объекта, которые и выводятся на карту. при загрузке нужных постов.
Еще как вариант, но тут уже плагин не поможет, и придется все писать вручную, это добавить дополнительный столбец в {prefix}_posts и хранить координаты объекта там.
Да, вы правы на счет амортизации, а забывают про нее скорее всего потому, что большая часть работает в на какую либо компанию и на счет амортизации вообще никогда не запаривается.
Кстати где то натыкался на проблему использования wp-cache и nginx, но в суть не вникал, поэтому сказать ничего не могу, попробуйте отключить кэшер временно.
Тут тогда может быть причина в иерархии шаблонов вордпресс подробнее объяснее это, попробуйте создать вручную файл 404.php поместите в него любой код, по идее файл должен будет открыться при попытке зайти на несуществующую страницу, если не поможет, то нужно уже будет смотреть настройки сервера. Так же как рекомендация попробуй перейти к формату ссылок по умолчанию. Ну и соответственно сравнивайте результаты после каждого действия.
Кстати у меня несколько сайтов не wordpress с самописными темами, и таких проблем никогда не возникало, правда сервер у меня работает на чистом апаче, в конце недели кстати мне настроят новый сервер только с nginx посмотрю как это будет на нем.