Есть виртуальная машина Ubuntu в VirtualBox.
вопрос - как создать на ней виртуальный диск? или он уже где-то есть?
Если Ubuntu'а откуда-то запускается, в установленном виде (не LiveCD), значит, она где-то установлена. А если так, значит, какой-то диск, на котором она стоит, очевидно есть?
Если Вам нужно целиком операционную систему, вместе с настройками и пр. лабудой скопировать - обычно это делается через специализированное ПО, например
dump.
В зависимости от формата, в котором диск создан - с ним могут работать разные программы. Какой-то из форматов (точно не подскажу, но найти не сложно), поддерживается даже самим Windows'ом, нативно.