../git rev-parse --show-toplevel
Зачем вы .gitignore положили в .idea?
создание новой ветки не помогает
можно забить на тот случай..
сидел в тойже папке где и делал инициализацию
был на ветке2
отктатило к прошлому сейву
А в чём сложность выполнить команду makepkg -si и выложить пакет?
Удалять эти папки надо было при закрытом PyCharm, как минимум.