Denis Verbin

Hesk - очень простенький и симпатичный.

Касательно железа, я бы посоветовал взять что-то из брендовых тауеров и добавить туда оперативки со временем. Обычный системник тоже хорошо, но живучесть железа существенно ниже при 24/7 работе.

Теперь по софту, используйте ESXi на железе, а в нем уже создавайте виртуальные машини. Там и роутер можно поднять (например на RouterOS или fSense и даже Kerio) и домен и все будет как отдельные сервера.
Если заинтересовала бесплатная замена ActiveDirectory, как выше советовали, посмотрите в сторону ClearOS, там и AD и почта и файловые шары. Но учтите, если эта связка (имею ввиду ActiveDirectory на Linux) - развалится, восстанавливать будет очень сложно.

При приеме на работу будут необходимы следующие навыки:
Уверенное понимание Windows
ActiveDirectory (разверните в виртуальном окружении)
Настройка почт/принтеров/сетевых шар
Огромным плюсом будет линукс администртрование:
Squid
Postfix/dovecot

Базовые вещи вроде:
Понимание работы dhcp
Настройка wifi роутеров/ap

Настройка Cisco/mikrotik/управляемых свичей будет большим бонусом.

В любом случае проблем будет много и разных, всего предварительно не выучишь, главное уметь искать решение. Но будьте готовы что сначала вы будете и щвец и жнец, ни о каком направлении администрирования по началу речи идти не будет, будут поручать все подряд.
Если стремится к чему-то в администрировании то это devops.
Также присоединюсь к предыдущим комментаторам, попробуйте пойти в разработку если вам это нравится, должно быть проще, админ в основном не очень благодарная профессия. Младшим в студию разработки вебсайтов вас точно должны взять, да и оплата повыше будет чем у младшего админа-подавана эникейщика.

Я бы установил в офисе mikrotik в качестве роутера, на сервере установил бы ESXi, залил-бы туда виртуалку с RouterOS, настроил бы между ними ipsec тоннель и радовался бы локалке :)

Попробуйте сделать общую папку на bittorent sync

Я думаю что после перезагрузки они пропадут. Было такое с mariadb, когда обновлял с 5.5 до 10.0 и не удалил старую версию перед установкой новой.

Остановитесь на своем VPS/Dedicated с ISPmanager/Vesta.

Скорее всего - слишком много хотите.
PS. Смотрели сколько часов у вас эти диски отработали уже?
PSS. Через smart (smartctl -d ata -a -i /dev/sda)

FlashFXP

Установка ОС, ввод в домен. Настройка почтовых клиентов, МФУ.
База Active Directory, установите на виртуалке АДшник, поиграйтесь.
Понимать что такое сеть и кто в ней выступает шлюзом по умолчанию, зачем DNS сервера и как от них зависит тот же AD.

(Запуск демона возьмите в скобки)